根据《山东省教育厅关于实施山东省高等学校质量与教学改革工程的意见》（鲁教高字[2011]9号）和济宁学院有关文件精神，学校组织专家对各单位申报的特色专业、精品课程、教学团队和实验教学示范中心等“教学质量与教学改革工程”项目进行了认真的评审。评审结果经学校批准确定：

特色专业（本科）4个：汉语言文学、生物工程、体育教育、化学。

精品课程15门：结构化学、化学工艺学、操作系统、分子生物学、植物生物学、遗传学、数学建模与数学实验、近世代数、数值计算方法、田径、英语听力、世界近代史、电磁学、中国古代文学、行政法与行政诉讼法。

教学团队6个：理论物理课程组教学团队、数学与应用数学专业教学团队、艺术设计专业教学团队、现代教育技术教学团队、中国古代文学教学团队、分析化学课程教学团队。